由于一些不可抗力的天气因素，比如雷、雨、雾等导致航班延误的现象最为多见
很多时候旅客看到眼前的天气是晴朗的却被告知航班因天气原因需要延误，其实天气原因不仅是指目的地机场的天气状况，主要结合出发地机场天气状况适不适宜起飞；目的地机场天气状况适不适宜降落；飞行航路上气象状况适不适宜飞行这三点进行综合综合分析。
还有一种情况就是去同一个目的地，有的飞机能飞，有的却被告知需要延误，出现这种情况时首先要明白飞机的起降和飞机的机型有很大的关系，同样的机型在每个航空公司的具体安全标准也有很大的差异，机长对当前的气象及趋势做出的决策也大不相同。
取决于机长对飞机状态、机场、气象等判断后的决定
民航法规定：机长发现民用航空器、机场、气象条件等不符合规定，不能保证飞行安全的，有权拒绝飞行
2. 航空管制
因空中交通管制造成的航班延误也十分常见，近年空中交通流量增长较大，飞行管理难以适应
一方面民航发展速度，航班量急剧增加，但是相应的地面设施，导致设备、服务保障方面发展缓慢，航路结构不合理，无法适应当前高速发展的民航业，对空域实行严格限制进行流量控制；另一方面由于空军活动涉及国防机密，往往会突然进行航空管制，遇到这种情况只能等待，没有理由，没有预计时间。
3. 飞机故障
随着飞行器技术飞速发展，飞机的安全系数也不断在提高，也具备详细的定期维护计划，绝大部分的故障隐患都会在这些例行检查中得到及时处理。
但也无法保证飞机设备不会突然出现故障，为了确保安全，彻底排除故障隐患就会造成一定程度的延误
机械故障必须确定解决，飞机才能上天
一般来说如果飞机故障地为该航空公司基地，排除故障时间较快，即使是大故障一时难以修复，由于在基地，也比较容易调配其他飞机，延误时间会较短。
但如果飞机故障地为外站，当地缺少必要的检修设备、零件和维修人员，这种情况造成延误的时间就很难确定
如果是飞机故障一时难以排除，即使调配其他飞机也需要较长时间
4. 旅客原因
在造成航班延误原因中，旅客原因的人为因素已成为造成航班延误的新的增长点
据统计，因旅客原因导致的航班延误占不正常航班的3%，和飞机故障造成的延误数量相差无几
机场、航空公司为晚到、四处乱走经停和完全听不到航班预告的旅客提供了耐心细致的服务，为了等待或者四处寻找这些少数旅客，往往也会造成飞机延误起飞，有时候这延迟几分钟就可能遇到天气、航空管制等原因是航班延误。
5. 航空公司原因
上述几种情况造成后续航班延误，民航都统计为晚到，所有飞机晚到的原因，航空公司都会统称为飞机调配
每架飞机航班计划都预先排好，现状是飞机飞行密度大，协调起来困难，前一航班出现任何疏漏都有可能引发后续航班的连锁反应，往往越到后面延误时间越长。
现在的航空公司机队规模都很小，可供调配余地弱，加上航线、机场等配套不是很完善，导致航班运行整体效率偏低，一旦发生意外情境，应变、调配能力较差，目前尚无完善可行的协调机制来解决此类问题。
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